一直想写个生物信息学学习的笔记或总结，今天总算是开个头。
环境配置：ubuntu14.04 lts
软件：hisat2、stringtile、R语言（包括各种package，在后面用到时候会写）、GSEA及其R语言包、R语言的FactoMiner（我感觉聚类分析有点没啥用）
思路：测序结果用hisat2比对，bam排序，stringtile计算counts、丰度等，用R语言进行各种分析（DESeq2-go-kegg、GSEA、Facto等）
很懒，写的可能只有我自己能看懂，今天第一篇，就为开个头。