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生物信息学笔记1

本文是全系列中第1 / 7篇:生物信息学笔记

一直想写个生物信息学学习的笔记或总结,今天总算是开个头。

环境配置:ubuntu14.04 lts

软件:hisat2、stringtile、R语言(包括各种package,在后面用到时候会写)、GSEA及其R语言包、R语言的FactoMiner(我感觉聚类分析有点没啥用)

思路:测序结果用hisat2比对,bam排序,stringtile计算counts、丰度等,用R语言进行各种分析(DESeq2-go-kegg、GSEA、Facto等)

很懒,写的可能只有我自己能看懂,今天第一篇,就为开个头。

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