肉碱包括左旋（L）及其异构体（D）两种，真正在体内起作用的是L-肉碱，但体外合成时会出现L和D两种形态，所以直接补充左旋肉碱去提高减肥效果还不是最好途径。
分类： Bioinfo
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定制版癌症疫苗获得成功
今天看到一篇“最新！美德宣布癌症疫苗大获成功，癌细胞已扩散也可痊愈！”，每天说癌症获得突破的“假新闻”特别多，因为对穷人来说或者说一般人来说确实没啥大用的研究太多，有一点进展就大吹特吹，当然能去研究还是非常值得鼓励的。
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生物信息学笔记7：对sam文件重新排序
通过hisat2比对得到sam文件，如果重复多次用同一个命令比对同一条序列，每次得到的sam文件其实是大小一样但内容顺序不同的文件，所以我们需要用软件进行重新排序。
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生物信息学笔记6：hisat2比对生成sam文件
在上一步，我们建立了index，可以在运行index命令的目录（我是在dnaseq\chrX_data\third\index，这个dnaseq目录是win10和linux的共享文件夹，关于该共享文件夹可能有些人可能还会有点弯路要走，我一开始是在linux下面找不到这个共享文件夹，这个后面如果有时间我会专门写一篇）下找到相应的文件如下图（里面包括了chrX.exon和chrX.ss这两个从gtf文件中提取的，以及剩下的就是index文件，有1-8，但是在比对时用chrX_tran代表）：
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生物信息学笔记4：hisat2的下载安装及环境配置
一、需要分析的序列，比如在samples文件夹里：
ERR188044_chrX_1.fastq.gz
ERR188044_chrX_2.fastq.gz
ERR188104_chrX_1.fastq.gz
ERR188104_chrX_2.fastq.gz
......
我就不一一列出来，这里列出来主要就是想说同一个序列有1和2，就是双端测序的意思
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生物信息学笔记3：练手序列的准备
本文参考了简书：RNA-seq数据分析---方法学文章的实战练习
我的启蒙文章，现在的生物信息学和以前的比真的是牛逼太多了，以前搞个blast、phylip等就好像差不多了，而实际上那些都算是比较简单的基本操作了。真正要搞懂的不单是碱基的差异，还有表达基因的差异、蛋白功能的差异......
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生物信息学笔记2：主机及环境配置
主机配置：e3-1230v2+24g内存。原来用的是e3-1230v2+8g内存的主机，以为这样自己学习捣鼓捣鼓够了，可是跑起来明显内存不够，于是加内存到24g，这样小一点的序列，比如X染色体这种的是能跑起来了
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生物信息学笔记1
一直想写个生物信息学学习的笔记或总结，今天总算是开个头。
环境配置：ubuntu14.04 lts
软件：hisat2、stringtile、R语言（包括各种package，在后面用到时候会写）、GSEA及其R语言包、R语言的FactoMiner（我感觉聚类分析有点没啥用）